要定时清洁激光切割机的循环水。循环水要使用温度在35℃以下的纯净水。如果温度高于35℃则需要重新换水或者在水中加入冰块以降低水的温度。清洗水箱之前要切断电源，然后把掉进水口水管，让激光管内的循环水流入水箱内，去除水箱里的水泵并清洗它，清洁完并替换好循环水后，把水泵放回原位，将衔接水泵的水管插入进水口，重新衔接好各接头。把水泵独自通电运行2-3分钟即可。
激光切割机发生风机吸力不足或排烟不畅的现象，这是因为机器长时间运作后，风机里面存留了很多的灰尘。此时则需要对风机进行清洁以保证风机的正常运行。同样需要在切掉电源后清除入风管与出风管里边的灰尘，然后将风机倒立，清洗风机里面的风叶，之后将风机重新安装好。
激光切割机的激光头有4块光学镜片，这些都需要进行定期清洁。清洗1号与2号镜片时不用取下，只需用擦镜纸沿镜片中央向外旋转式擦洗。3号镜片与聚焦镜则需要从镜架中取出，然后再用相同的方法进行擦洗，擦洗结束后按原样装回即可。